Des del començament de la sèrie de televisió, el Naruto L'estructura de poder s'ha mantingut gairebé sense canvis. Shinobi va donar forma a l'energia del chakra dins d'ells i va utilitzar gestos amb les mans per canalitzar-la en cops de ninjutsu i genjutsu.
Senjutsu va afegir energia ambiental natural a l'equació, tot i que els efectes del Sage Mode no eren tan diferents del que podia aconseguir el chakra. Les eines científiques ninja introduïdes per Boruto han trencat el patró i han permès als ciutadans comuns mantenir-se al dia amb els shinobi convencionals fins a cert punt, però la seva innovació més recent, Shinjutsu, amenaça de superar-los completament, i l'origen d'aquest nou poder és caòtic.
L'origen de Shinjutsu es pot remuntar a un ésser divino anomenat Otsutsuki Shibai, segons Amado Sanzu. Shibai va executar bé la comissió Otsutsuki durant la seva vida. Va governar diversos planetes i va fer que tota la vida existent fos un arbre diví. Shibai viatjaria a un altre món i duria a terme la seva interminable aniquilació còsmica després de menjar-se el fruit que donava. La força d'en Shibai va augmentar fins a un nivell semblant a Déu després de repetir aquest cicle durant innombrables eons.
Shinjutsu és el terme utilitzat per descriure les habilitats excepcionals de Shibai. El Shinjutsu, en contrast amb el Ninjutsu tradicional, que està limitat per la reserva i l'experiència de chakra d'un shinobi, va permetre a Shibai realitzar fets celestials. Podria superar fàcilment fins i tot l'usuari de Ninjutsu més hàbil sense utilitzar senyals manuals. Amb un escombrat del palmell de la mà, podia controlar les energies del vent i utilitzar Shinjutsu per donar-se poders ridículs, alguns que no estaven totalment relacionats amb les habilitats que els fans de Naruto solen associar amb el chakra. Segons el punt de vista d'Amado, Shibai buscava la divinització i va sacrificar el seu cos mortal per residir en un regne superior.
La 'mort' de Shibai va fer possible que els membres de Kara comparteixin Shinjutsu. Shinjutsu, a diferència del Ninjutsu, no es pot aprendre; en canvi, una persona deu haver tingut una part de l'ADN de Shibai empeltat a sobre perquè es manifesti. Això, per descomptat, només s'aplica a aquells que estan en el cercle proper de Kara i als que podrien servir com a vaixells de resurrecció de l'Otsutsuki. A més de les bandes negres de Code, les habilitats de reflexió del dany psíquic de Daemon i els cubs de disrupció d'Isshiki, alguns exemples de Shinjutsu inclouen el karma i els Jutsus derivats que utilitzen Boruto i Kawaki. Aquestes habilitats eren originalment de Shibai, però la institució Kara les ha cooptat per als seus propis propòsits.
El Shinjutsu de Boruto no es pot descriure adequadament com un Ninjutsu sense límits. Membres de Kara i Otsutsuki han demostrat anteriorment com fins i tot Naruto i Sasuke, els dos practicants més formidables del Ninjutsu clàssic, poden ser destruïts per Shinjutsu. Genjutsu i el puny suau de Hyuga, que tenen com a objectiu interrompre la xarxa de xacres, són ineficaços contra els practicants de Shinjutsu, ja que no necessiten donar forma ni manipular el xacre de cap manera.
Si utilitzar un ordinador amb un compte de convidat fos l'equivalent a Ninjutsu, Shinjutsu seria equivalent a utilitzar un ordinador amb drets d'administrador complets. Amado va dir que l'art de teixir signes i concentrar el chakra d'un per utilitzar el Ninjutsu era simplement una còpia feble del que és capaç Shinjutsu i que el grau de força de Shibai Otsutsuki no tenia igual. Aquest desenvolupament és coherent amb què la sèrie Naruto ja ha dit sobre el Ninjutsu i les arrels històriques del chakra.
Els Shinobi han heretat tradicionalment les seves habilitats dels Otsutsuki. La revelació sobtada de l'origen i la força de Shinjutsu per part d'Amado només serveix per destacar com de degradat estava el Ninshu del Savi dels Sis Camins i fa que els vilans de Boruto siguin encara més perillosos.
